Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms