Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pou2f1P25425 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pou2f1P25425 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pou2f1P25425 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Pou2f1P25425 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pou2f1P25425 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pou2f1P25425 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Pou2f1P25425 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pou2f1P25425 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pou2f1P25425 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pou2f1P25425 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms