Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkcaP20444 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms