Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl13aP19253 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl13aP19253 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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