Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NefhP19246 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NefhP19246 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NefhP19246 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NefhP19246 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NefhP19246 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NefhP19246 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NefhP19246 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NefhP19246 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NefhP19246 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NefhP19246 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NefhP19246 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NefhP19246 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NefhP19246 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NefhP19246 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NefhP19246 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NefhP19246 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NefhP19246 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NefhP19246 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NefhP19246 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NefhP19246 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NefhP19246 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NefhP19246 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NefhP19246 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NefhP19246 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NefhP19246 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NefhP19246 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NefhP19246 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NefhP19246 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NefhP19246 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NefhP19246 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NefhP19246 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NefhP19246 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NefhP19246 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NefhP19246 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NefhP19246 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NefhP19246 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NefhP19246 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NefhP19246 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NefhP19246 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NefhP19246 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NefhP19246 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NefhP19246 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NefhP19246 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NefhP19246 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NefhP19246 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NefhP19246 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NefhP19246 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NefhP19246 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NefhP19246 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NefhP19246 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NefhP19246 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NefhP19246 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NefhP19246 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NefhP19246 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NefhP19246 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NefhP19246 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NefhP19246 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NefhP19246 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NefhP19246 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NefhP19246 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NefhP19246 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NefhP19246 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NefhP19246 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NefhP19246 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NefhP19246 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NefhP19246 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NefhP19246 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NefhP19246 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NefhP19246 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NefhP19246 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NefhP19246 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NefhP19246 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NefhP19246 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NefhP19246 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NefhP19246 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NefhP19246 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NefhP19246 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NefhP19246 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NefhP19246 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NefhP19246 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NefhP19246 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NefhP19246 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NefhP19246 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NefhP19246 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NefhP19246 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NefhP19246 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NefhP19246 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NefhP19246 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NefhP19246 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NefhP19246 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NefhP19246 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NefhP19246 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NefhP19246 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NefhP19246 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NefhP19246 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NefhP19246 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NefhP19246 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NefhP19246 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NefhP19246 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms