Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18529 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
P18529 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18529 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18529 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18529 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18529 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18529 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18529 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18529 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18529 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18529 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18529 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18529 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18529 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18529 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18529 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18529 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18529 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18529 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18529 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18529 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18529 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18529 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18529 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18529 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18529 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18529 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18529 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18529 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18529 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
P18529 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18529 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18529 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18529 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18529 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18529 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18529 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18529 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18529 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18529 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18529 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18529 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18529 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18529 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18529 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18529 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18529 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18529 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18529 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18529 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18529 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18529 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18529 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18529 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18529 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18529 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18529 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18529 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18529 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18529 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18529 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18529 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18529 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18529 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18529 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18529 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18529 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18529 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18529 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18529 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18529 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18529 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18529 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
P18529 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
P18529 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
P18529 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18529 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18529 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18529 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18529 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18529 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18529 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18529 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18529 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18529 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18529 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18529 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18529 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18529 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18529 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18529 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18529 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18529 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
P18529 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18529 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18529 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18529 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18529 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18529 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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