Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpraP18052 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtpraP18052 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtpraP18052 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtpraP18052 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PtpraP18052 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PtpraP18052 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtpraP18052 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpraP18052 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpraP18052 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpraP18052 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpraP18052 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpraP18052 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpraP18052 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtpraP18052 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PtpraP18052 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtpraP18052 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtpraP18052 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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