Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb1P17919 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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