Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PcnaP17918 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PcnaP17918 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms