Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PcnaP17918 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PcnaP17918 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PcnaP17918 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms