Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgfb3P17125 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms