Protein–RNA interactions for Protein: P15388

Kcnc1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnc1P15388 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnc1P15388 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms