Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd44P15379 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd44P15379 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd44P15379 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd44P15379 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd44P15379 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd44P15379 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd44P15379 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd44P15379 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd44P15379 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd44P15379 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms