Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp54P14576 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54P14576 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Srp54P14576 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Srp54P14576 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54P14576 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54P14576 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms