Protein–RNA interactions for Protein: P14097

Ccl4, C-C motif chemokine 4, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl4P14097 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl4P14097 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl4P14097 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms