Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DmdP11531 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DmdP11531 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DmdP11531 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DmdP11531 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DmdP11531 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DmdP11531 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DmdP11531 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DmdP11531 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DmdP11531 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DmdP11531 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DmdP11531 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DmdP11531 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DmdP11531 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DmdP11531 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DmdP11531 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DmdP11531 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DmdP11531 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DmdP11531 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DmdP11531 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DmdP11531 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DmdP11531 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DmdP11531 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DmdP11531 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DmdP11531 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DmdP11531 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DmdP11531 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DmdP11531 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DmdP11531 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DmdP11531 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DmdP11531 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DmdP11531 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DmdP11531 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DmdP11531 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DmdP11531 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DmdP11531 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DmdP11531 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DmdP11531 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DmdP11531 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DmdP11531 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DmdP11531 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DmdP11531 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DmdP11531 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DmdP11531 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DmdP11531 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DmdP11531 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DmdP11531 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DmdP11531 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DmdP11531 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DmdP11531 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DmdP11531 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DmdP11531 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DmdP11531 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DmdP11531 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DmdP11531 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DmdP11531 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DmdP11531 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DmdP11531 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DmdP11531 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DmdP11531 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DmdP11531 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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DmdP11531 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DmdP11531 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DmdP11531 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DmdP11531 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DmdP11531 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DmdP11531 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DmdP11531 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DmdP11531 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DmdP11531 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DmdP11531 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DmdP11531 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DmdP11531 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DmdP11531 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DmdP11531 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DmdP11531 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DmdP11531 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DmdP11531 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DmdP11531 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DmdP11531 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DmdP11531 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DmdP11531 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DmdP11531 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DmdP11531 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DmdP11531 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DmdP11531 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DmdP11531 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DmdP11531 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DmdP11531 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DmdP11531 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DmdP11531 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DmdP11531 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DmdP11531 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DmdP11531 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms