Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spp1P10923 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Spp1P10923 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spp1P10923 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spp1P10923 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spp1P10923 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spp1P10923 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spp1P10923 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spp1P10923 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Spp1P10923 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms