Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxd4P10628 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Hoxd4P10628 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms