Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P10404 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P10404 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P10404 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P10404 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P10404 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P10404 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P10404 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
P10404 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P10404 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P10404 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P10404 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P10404 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P10404 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P10404 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P10404 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P10404 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P10404 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P10404 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P10404 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P10404 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P10404 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P10404 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P10404 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P10404 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P10404 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P10404 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P10404 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P10404 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P10404 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P10404 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P10404 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P10404 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P10404 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P10404 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P10404 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P10404 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P10404 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P10404 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P10404 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P10404 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P10404 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P10404 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P10404 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P10404 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P10404 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P10404 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P10404 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P10404 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P10404 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P10404 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P10404 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P10404 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P10404 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P10404 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P10404 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P10404 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P10404 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P10404 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P10404 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P10404 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P10404 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P10404 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P10404 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P10404 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P10404 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P10404 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P10404 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P10404 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P10404 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P10404 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P10404 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P10404 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P10404 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P10404 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P10404 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P10404 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P10404 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P10404 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P10404 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P10404 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P10404 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P10404 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P10404 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P10404 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P10404 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P10404 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P10404 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P10404 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P10404 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P10404 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P10404 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P10404 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P10404 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P10404 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P10404 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
P10404 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
P10404 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P10404 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P10404 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms