Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms