Protein–RNA interactions for Protein: P09926

Surf2, Surfeit locus protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf2P09926 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf2P09926 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Surf2P09926 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf2P09926 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf2P09926 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf2P09926 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf2P09926 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Surf2P09926 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms