Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spta1P08032 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spta1P08032 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spta1P08032 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spta1P08032 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Spta1P08032 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spta1P08032 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spta1P08032 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spta1P08032 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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