Protein–RNA interactions for Protein: P06336

Ig epsilon chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06336 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06336 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06336 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06336 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06336 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P06336 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P06336 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P06336 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P06336 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P06336 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06336 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06336 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06336 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06336 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06336 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06336 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06336 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06336 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06336 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06336 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P06336 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06336 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06336 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06336 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06336 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06336 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06336 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06336 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06336 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06336 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06336 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06336 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06336 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06336 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06336 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06336 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06336 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06336 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06336 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06336 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06336 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06336 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06336 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06336 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06336 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06336 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P06336 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06336 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06336 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06336 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06336 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06336 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06336 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06336 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06336 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06336 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P06336 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06336 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06336 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06336 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P06336 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06336 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06336 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06336 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06336 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06336 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06336 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06336 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06336 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06336 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P06336 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06336 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06336 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06336 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06336 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06336 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P06336 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06336 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06336 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06336 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06336 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06336 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06336 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06336 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06336 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06336 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06336 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06336 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06336 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06336 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06336 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06336 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06336 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06336 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06336 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P06336 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06336 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06336 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P06336 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06336 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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