Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-Eb1P04230 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms