Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-Ab1P01921 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
H2-Ab1P01921 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
H2-Ab1P01921 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Ab1P01921 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms