Protein–RNA interactions for Protein: P01669

Ig kappa chain V-III region PC 7769, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01669 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01669 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01669 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01669 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01669 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01669 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01669 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01669 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01669 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01669 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01669 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01669 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01669 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01669 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01669 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01669 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01669 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01669 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01669 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01669 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01669 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01669 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01669 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01669 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01669 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01669 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01669 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01669 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01669 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01669 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01669 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01669 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01669 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01669 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01669 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01669 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01669 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01669 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01669 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01669 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01669 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01669 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01669 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01669 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01669 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01669 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01669 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01669 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01669 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01669 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01669 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01669 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01669 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01669 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01669 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01669 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01669 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01669 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01669 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01669 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01669 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01669 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01669 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01669 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01669 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01669 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01669 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01669 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01669 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01669 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01669 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01669 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01669 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01669 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01669 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01669 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01669 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01669 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01669 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01669 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01669 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01669 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01669 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01669 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01669 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01669 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01669 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01669 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01669 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01669 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01669 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01669 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01669 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01669 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01669 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01669 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01669 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01669 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01669 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01669 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms