Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capns1O88456 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns1O88456 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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