Protein–RNA interactions for Protein: O88410

Cxcr3, C-X-C chemokine receptor type 3, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr3O88410 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr3O88410 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr3O88410 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr3O88410 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr3O88410 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr3O88410 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr3O88410 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr3O88410 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr3O88410 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr3O88410 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcr3O88410 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcr3O88410 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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