Protein–RNA interactions for Protein: O70401

Tspan6, Tetraspanin-6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan6O70401 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan6O70401 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms