Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cbx4O55187 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx4O55187 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms