Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eif6O55135 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif6O55135 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif6O55135 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif6O55135 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif6O55135 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif6O55135 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms