Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg2O55111 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dsg2O55111 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dsg2O55111 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dsg2O55111 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dsg2O55111 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dsg2O55111 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg2O55111 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg2O55111 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg2O55111 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg2O55111 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg2O55111 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg2O55111 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg2O55111 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg2O55111 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg2O55111 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg2O55111 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg2O55111 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg2O55111 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg2O55111 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg2O55111 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg2O55111 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg2O55111 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg2O55111 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg2O55111 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg2O55111 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg2O55111 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg2O55111 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms