Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema6bO54951 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema6bO54951 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema6bO54951 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema6bO54951 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema6bO54951 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema6bO54951 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema6bO54951 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema6bO54951 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema6bO54951 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema6bO54951 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema6bO54951 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema6bO54951 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema6bO54951 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema6bO54951 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema6bO54951 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema6bO54951 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema6bO54951 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema6bO54951 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema6bO54951 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema6bO54951 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema6bO54951 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms