Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sp100O35892 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sp100O35892 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sp100O35892 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sp100O35892 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Sp100O35892 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Sp100O35892 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Sp100O35892 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sp100O35892 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms