Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn6O35646 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn6O35646 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn6O35646 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn6O35646 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn6O35646 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn6O35646 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms