Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xbp1O35426 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms