Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd2O35392 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd2O35392 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms