Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pkd2O35245 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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Pkd2O35245 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd2O35245 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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