Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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H2-Q1O19441 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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H2-Q1O19441 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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H2-Q1O19441 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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H2-Q1O19441 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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H2-Q1O19441 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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H2-Q1O19441 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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H2-Q1O19441 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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H2-Q1O19441 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Q1O19441 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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