Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
MsmbO08540 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MsmbO08540 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MsmbO08540 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
MsmbO08540 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MsmbO08540 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
MsmbO08540 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MsmbO08540 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MsmbO08540 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
MsmbO08540 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms