Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
BC117090L7N257 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms