Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Colca2F8VPY8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colca2F8VPY8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms