Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
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