Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5861F6VCN9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5861F6VCN9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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