Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm29094F6Q785 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm29094F6Q785 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm29094F6Q785 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm29094F6Q785 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm29094F6Q785 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm29094F6Q785 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm29094F6Q785 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm29094F6Q785 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm29094F6Q785 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm29094F6Q785 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm29094F6Q785 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm29094F6Q785 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm29094F6Q785 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm29094F6Q785 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm29094F6Q785 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm29094F6Q785 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm29094F6Q785 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm29094F6Q785 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm29094F6Q785 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm29094F6Q785 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms