Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ccdc7bE9Q9Y3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ccdc7bE9Q9Y3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ccdc7bE9Q9Y3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ccdc7bE9Q9Y3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ccdc7bE9Q9Y3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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