Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Simc1E9Q6E9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms