Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms