Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdr1E9Q0B4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms