Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cngb1E1AZ71 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cngb1E1AZ71 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cngb1E1AZ71 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cngb1E1AZ71 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cngb1E1AZ71 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cngb1E1AZ71 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cngb1E1AZ71 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cngb1E1AZ71 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cngb1E1AZ71 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cngb1E1AZ71 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cngb1E1AZ71 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cngb1E1AZ71 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cngb1E1AZ71 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cngb1E1AZ71 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cngb1E1AZ71 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cngb1E1AZ71 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cngb1E1AZ71 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cngb1E1AZ71 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cngb1E1AZ71 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cngb1E1AZ71 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cngb1E1AZ71 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cngb1E1AZ71 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Cngb1E1AZ71 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cngb1E1AZ71 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cngb1E1AZ71 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cngb1E1AZ71 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cngb1E1AZ71 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cngb1E1AZ71 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cngb1E1AZ71 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cngb1E1AZ71 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cngb1E1AZ71 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cngb1E1AZ71 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cngb1E1AZ71 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cngb1E1AZ71 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cngb1E1AZ71 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Cngb1E1AZ71 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Cngb1E1AZ71 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms