Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC048679D3YXE9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
BC048679D3YXE9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
BC048679D3YXE9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC048679D3YXE9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC048679D3YXE9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC048679D3YXE9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC048679D3YXE9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC048679D3YXE9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC048679D3YXE9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC048679D3YXE9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC048679D3YXE9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BC048679D3YXE9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC048679D3YXE9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC048679D3YXE9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC048679D3YXE9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC048679D3YXE9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC048679D3YXE9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC048679D3YXE9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC048679D3YXE9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC048679D3YXE9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BC048679D3YXE9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC048679D3YXE9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC048679D3YXE9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC048679D3YXE9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC048679D3YXE9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC048679D3YXE9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC048679D3YXE9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC048679D3YXE9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC048679D3YXE9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC048679D3YXE9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC048679D3YXE9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC048679D3YXE9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC048679D3YXE9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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